Protein–RNA interactions for Protein: F8WBC2

INMT-MINDY4, INMT-MINDY4 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INMT-MINDY4F8WBC2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
INMT-MINDY4F8WBC2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
INMT-MINDY4F8WBC2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms