Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8VWA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8VWA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8VWA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F8VWA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
F8VWA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F8VWA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VWA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VWA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VWA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms