Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PMD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PMD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PMD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PMD0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PMD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PMD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PMD0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PMD0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PMD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms