Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATL2C9JE40 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms