Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C2CD4DB7Z1M9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4DB7Z1M9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms