Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DLN1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DLN1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DLN1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DLN1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4DLN1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DLN1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
B4DLN1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
B4DLN1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
B4DLN1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DLN1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DLN1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DLN1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms