Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRM3A6NNA2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms