Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms