Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L4A6NCW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms