Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms