Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AC011466.4-201ENST00000623064 1614 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 C1orf131-201ENST00000318906 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 FBXO3-202ENST00000448981 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 PRKG2-202ENST00000395578 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ICOS-201ENST00000316386 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 DPT-201ENST00000367817 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 LRRIQ4-201ENST00000340806 1827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CPNE8-203ENST00000538596 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 STK33-202ENST00000358872 1991 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 AC245517.1-201ENST00000444224 1262 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 HP-216ENST00000570083 1270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC016590.1-203ENST00000590889 547 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 CAMK1G-202ENST00000361322 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPRJQ12913 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 IGKV2-10-201ENST00000518834 351 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC022239.2-201ENST00000533322 594 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC073254.1-213ENST00000596622 704 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 AC073254.1-211ENST00000598700 761 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPRJQ12913 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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