Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.38■■■■□ 3.42
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms