Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A4Q9Y6R1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms