Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA3Q9Y6H8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA3Q9Y6H8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms