Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP3Q9Y6F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms