Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPQQ9Y646 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms