Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX10Q9Y5X0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms