Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms