Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF3AQ9Y496 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms