Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM2AQ9Y2K7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms