Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC50.61■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC50.58■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC50.56■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC50.55■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC50.54■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC50.54■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.68
NISCHQ9Y2I1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC50.48■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.47■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC50.46■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms