Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF13BQ9Y275 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF13BQ9Y275 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms