Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM50BQ9Y247 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms