Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms