Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF19Q9UMS4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms