Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPCN1Q9ULQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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