Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH9Q9ULB4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms