Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP4Q9UKK3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms