Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA1Q9UJY5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA1Q9UJY5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms