Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms