Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SCOCQ9UIL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCOCQ9UIL1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms