Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms