Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF1Q9UBU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms