Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLKQ9UBT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLKQ9UBT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms