Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNKQ9P0W0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNKQ9P0W0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms