Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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TMOD4Q9NZQ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD4Q9NZQ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD4Q9NZQ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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