Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms