Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKD2L2Q9NZM6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKD2L2Q9NZM6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms