Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms