Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIS18AQ9NYP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms