Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms