Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSS2Q9NR19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms