Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms