Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS4Q9NQG7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS4Q9NQG7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms