Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms