Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms