Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRM3Q9NNZ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRM3Q9NNZ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms