Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP110Q9HB58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms