Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A2Q9HAB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A2Q9HAB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A2Q9HAB3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms