Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C10orf88Q9H8K7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms